ตามข้อกำหนดเฉพาะ 1 สำหรับการผลิตน้ำบริโภคในภาชนะบรรจุที่ปิดสนิท น้ำแร่ธรรมชาติ และน้ำแข็งบริโภค ที่ผ่านกรรมวิธีการกรอง กรณีผลิต "น้ำแข็ง" เหตุใด อย. จึงบังคับเฉพาะ "น้ำแข็งบริโภค" ซึ่งต่างไปจากประกาศกระทรวงสาธารณสุข ฉบับที่ 78 (พ.ศ.2527) เรื่อง น้ำแข็ง ซึ่งบังคับทั้ง "น้ำแข็งใช้รับประทานได้ "และ "น้ำแข็งใช้รับประทานไม่ได้"

จากกรณีที่มีการ witness หัวหน้าผู้ตรวจประเมินจากหน่วยตรวจหรือหน่วยรับรอง โดยสำนักงานคณะกรรรมการอาหารและยา แล้วพบว่า Lead Auditor มิได้ตรวจสอบกระบวนการหลัก และมิได้รับผิดชอบในการสรุปผลการตรวจในทุกประเด็น ซึ่ง Lead Auditor ไม่ควรมอบหมาย Auditor ตรวจกระบวนการหลัก และมอบหมายตนเองรับผิดชอบเฉพาะส่วนสนับสนุนรอบนอกอาคารนั้น

กรณีอาหารนำเข้าสามารถใช้ข้อมูลฉลากโภชนาการที่แสดงตามข้อกำหนดของประเทศต้นทาง โดยไม่ส่งตรวจวิเคราะห์คุณค่าทางโภชนาการใหม่โดยห้องปฏิบัติการในประเทศไทยได้หรือไม่